怎么在ncbi上看基因的完整序列
mvista怎么使用？
mvista怎么使用？
使用中的几点心得：
1、除了在线版的，我们还可以在网站上填写信息申请离线的软件。需要先自己比对，然后要按照一定的格式来制作文件，当然你还必须得安装java才能运行软件；总之，感觉没有在线版的方便。
2、mVISTA的web服务器声明也接受GFF3格式的注释。
NCBI网站上可以下载GFF3格式的文件，
注意：下载后导入mVISTA，结果显示只注释了前面一半的基因，后一半序列没有注释。所以，后来就在网上下了一个perl脚本，来自于简书的《mVISTA格式文件：由Perl脚本处理GenBank注释文件而来》，然后把NCBI上下载的参考序列的gb文件转换成了mVISTA格式文件，注释的这个问题就算解决了。
3、VISTA Browser打不开（用IE浏览器打开，网页直接就未响应，可能是我电脑计算力太低了？搞不懂），直接下载的pdf结果。pdf格式是矢量图格式（之前的文章里讨论过矢量图与位图的区别），因此就可以尽情编辑啦，只要你用的pdf编辑器有编辑功能
求助：怎么从基因组数据库中找出某基因家族？
如果你知道你要找的基因的名字应该是可以很快的找到你要的序列，那你只能通过做比对来判断了一般提交NCBI上的基因组都有预测CDS的，所以上面都有标出每个CDS的可能功能及相应蛋白或酶的名字。如果没有。可以用BIOEDIT比对试试
如何区分目的基因在启动子上下游？
一般编码蛋白的基因都在启动子下游。
如果是非编码蛋白基因，去NCBI或者ENCODE等数据库查找目的基因的完整序列，上面会有启动子位点和目的基因序列，下载下来然后随便用一个bioEdit或者DNAstar工具找到它的启动子位点和目的基因序列。
怎么查鲟鱼的基因序列？
在NCBI上面找在上边查找。
查找基因序列方法是： 首先打开NCBI网站首页，然后在search一栏中选择nucleotide，在框中输入要的基因序列名称，点击search就行。
然后会出来很多结果，因为很多基因是同名的，或是一个基因在不同种属中不一样，寻找要的基因序列就行了。注意的是，要确定基因名称是否是统一的，找到基因序列，蛋白序列就很容易了，因为结果中会显示该基因的蛋白序列。