多序列比对的过程及结果输出

什么叫同源序列法?

什么叫同源序列法?

所谓同源序列,简单地说,是指从某一共同祖先经趋异进化而形成的不同序列。必须指出,相似性(similarity)和同源性(homology)是两个完全不同的概念。
相似性是指序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相同DNA碱基或氨基酸残基顺序所占比例的高低

怎么比对测序序列与正常的比值?

比对测序序列与正常的比值,1假设你测的是一个基因的序列,如果已知这个基因的序列,则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对,分析看两者在哪个地方不对应,不对应的地方即为突变的地方比对的软件有sequencher,或者去NCBI网站点击BLAST进行2如果你测的是一个以前未知的序列,那么要测几个不同的单克隆,将测得的结果进行比对,分析一致的地方以及不一致的地方,是这么比对测序序列与正常的比值。

怎样分析多序列比对结果,结构域?

多序列比对在分子生物学中是一个基本方法,用来发现特征序列,进行蛋白分类,证明序列间的同源性,帮助预测新序列二级结构与三级结构,确定PCR引物,以及在分子进化分析方面均有很大帮助,ClustalW(Dos版本)很适合这些方面的要求,ClustalX是window版本。用Clustal比对后的序列,有时候我们需要转为图片放在文章作详细方析,但大部分人的方法都是直接截图,这样的后果就是图片一点都不美观。如果你是想要发表文章或其它比较重要的用途,图片的质量还是需要高一点的。

ncbi怎么通过基因序列比对?

以下是NCBI进行序列比对,查找相关序列注释的基础用法,
1.打开NCBI网站:National Center for Biotechnology Information
2.点击popular resources的BLAST工具,进入工具主页面。
3.根据自己要进行比对的序列的类型,选择适合的blast。
4.点击blast后,在转跳页面等待一分钟左右,直到弹出信息页面。
5.点击这条序列的accession,即可转跳到genbank中查看这条序列的注释信息。
6.点击这里这条基因的链接,会转跳到gene数据库页面,看到更多的信息。
7.下载这条序列的fasta格式。